《仙剑奇侠传五前传》的结局非常悲壮，是国产单机游戏中著名的“致郁系”结局之一，游戏结局紧接《仙剑奇侠传五》的剧情,主要人物的命运如下：

夏侯瑾轩与瑕（结局留白/悲剧） 在最终决战中，夏侯瑾轩为了阻止魔翳的阴谋，与瑕一同坠入悬崖（司云崖），游戏并没有直接展示他们的尸体，而是通过暮菖兰在崖边等待多年、最终看到一男一女两个身影归来的画面作为结尾，结合《仙剑五》中并未提及瑾轩和瑕，以及游戏中关于“瑕”身体被枯木（魔翳）占据的设定，普遍认为两人已经身亡,最后的画面是暮菖兰的幻觉或美好的愿望。

暮菖兰（孤独终老） 暮菖兰在结局中活了下来，她回到了故乡，照顾着被治愈的村民（她的弟弟妹妹们），但内心始终无法释怀，她每年都会去司云崖等待瑾轩和瑕，最终在多年后（已是白发苍苍）似乎看到了两人的幻影,她的一生都在怀念与等待中度过。

龙溟与凌波（双双殒命） 这一对在游戏中期就已经悲剧收场，龙溟为了取水灵珠救族人，死于神降密境；凌波因盗取神农鼎放走龙溟，被永久囚禁在蜀山禁洞，最终因灵力耗尽而化为枯骨（在《仙剑五》中可见其魂魄）。

谢沧行（兵解牺牲） 谢沧行在锁妖塔（蜀山）一战中，为了加固神魔之井的封印，阻止姜世离，毅然选择“兵解”（牺牲自己肉身与修为），以剑气和魂魄加固封印,壮烈牺牲。

姜承（姜世离） 姜承最终被魔翳利用，彻底魔化成为姜世离，建立了净天教，结局中他被蜀山封印，直至《仙剑五》时期才破封而出,但最终仍难逃悲剧命运。

皇甫卓 皇甫卓活了下来，成为皇甫世家家主，他一生坚守正道，但在《仙剑五》时期已是一位老人，且家族衰落,故人皆逝。

《仙剑五前传》的结局是一个“全员悲剧”的收尾，主角团死的死、散的散、等的等，完美衔接了《仙剑五》中“蜀山七圣”和“净天教”的背景，同时也解释了《仙剑五》中许多未解之谜（如姜世离的过往、龙溟的牺牲等），整个结局充满了宿命感和无力感,是仙剑系列中剧情评价极高的一部。