《仙剑奇侠传五前传》的结局非常悲壮，是整部系列中著名的“致郁”结局之一，故事结局紧接《仙剑奇侠传五》的正传剧情,主要人物的命运如下：

夏侯瑾轩与瑕（结局留白/悲剧） 在最终决战中，夏侯瑾轩和瑕为了阻止魔翳的阴谋，保护人界，联手对抗，最后时刻，瑕为了不让身体被魔翳利用，选择与魔翳同归于尽（或自我牺牲），夏侯瑾轩不愿独活，抱着瑕一起坠入了悬崖（司云崖），游戏并没有直接给出两人的尸体，而是以开放式结局收尾，留给玩家一线希望（民间有猜测他们被云来石所救隐居，但官方正统剧情中通常被视为悲剧/生死不明）。

龙溟与凌波（死别） 龙溟为了拯救夜叉族，前往人界寻找水灵珠，最终在神降秘境中被三神器的力量重伤而死，凌波为了帮助龙溟，盗取门派禁物，被囚禁在蜀山禁洞，最终因伤势过重且心死，在禁洞中坐化,两人都没能完成彼此的承诺。

谢沧行（兵解牺牲） 谢沧行（罡斩）在蜀山禁洞为了保护姜世离（姜承）不破坏神魔之井的封印，也为了守护蜀山，选择兵解（牺牲自己）加固封印，他的死是剧情中极具震撼力的一幕，那句“剑者，心之刃也”成为经典。

姜承/姜世离（成为魔君） 姜承在经历了人界的背叛与排挤后，最终接受了魔族血统，成为净天教教主“姜世离”，结局中他因决战失败被封印在蜀山（后由《仙剑五》剧情展开后续）。

皇甫卓与暮菖兰 皇甫卓回到皇甫家，承担起家主的责任，终身未娶（心中挂念着瑾轩等人），暮菖兰则回到了故乡，照顾家人，她与瑾轩等人的羁绊成为她一生的回忆,结局中她独自站在崖边怀念故人。

《仙剑五前传》的结局以“全员悲剧”著称，主要角色或死或散，只有少数人（如皇甫卓、暮菖兰）活下来承担记忆，结局动画中，暮菖兰在司云崖等待，最终看到远处似乎有瑾轩和瑕的身影（是否真实存在有争议），配合主题曲《有情燕》,营造出强烈的悲情与遗憾感。